ภาวะแทรกซ้อนบางส่วนของ IBD อาจเป็นอันตรายถึงชีวิต
หลายคนเชื่อว่า โรคลำไส้อักเสบ (IBD) เป็นสาเหตุของอาการท้องร่วงเท่านั้น แต่ยังมีผลต่อลำไส้เล็กและลำไส้เล็กด้วยวิธีต่างๆ ภาวะแทรกซ้อนในลำไส้ของ IBD ได้แก่ ฝีฝีกล้ามเนื้อลำไส้การเจาะลำไส้มะเร็งลำไส้ใหญ่รอยแยกร่องลึกอาการแย่ลงในช่วงมีประจำเดือนและพิษ megacolon ภาวะแทรกซ้อนบางอย่างของ IBD (Crohn's disease และ ulcerative colitis) อาจเป็นอันตรายต่อชีวิตและต้องได้รับการรักษาอย่างทันท่วงทีเพื่อป้องกันไม่ให้เกิดโรคร้ายแรงขึ้น
ฝี
ฝีซึ่งพบได้บ่อยในโรค Crohn มากกว่าในลำไส้ใหญ่อักเสบที่เป็นแผลเป็นคือการสะสมของหนองที่บริเวณที่มีการติดเชื้อ อาจเกิดขึ้นภายในร่างกายซึ่งไม่สามารถมองเห็นได้เช่นในผนังลำไส้หรือภายนอกเช่นบนผิวหนัง
ฝีในตัวอาจแก้ปัญหาได้ด้วยการรักษาด้วยยาปฏิชีวนะ แต่ถ้าไม่ใช้ก็จะต้องมีการระบายน้ำ นี้อาจทำได้โดยการใส่สายสวนผ่านผิวหนังไปยังเว็บไซต์ฝี สายสวนอาจใส่ในรูปแบบอื่นเช่นผ่านผนังกระเพาะอาหาร ในบางกรณีจำเป็นต้องผ่าตัดเพื่อระบายฝี
ลำไส้อุดตัน
ลำไส้อุดตันเกิดขึ้นเมื่อส่วนหนึ่งของ ลำไส้เล็ก หรือ ลำไส้ใหญ่ ถูกปิดกั้นบางส่วนหรือทั้งหมดป้องกันไม่ให้ร่างกายเสียจากการเดินทางผ่าน สิ่งกีดขวางมักมาพร้อมกับอาการปวดอาเจียนและ ท้องผูก ในบางกรณี หลอดอักเสบ จะช่วยบรรเทาอาการได้ แต่การผ่าตัดอาจจำเป็นต้องล้างคราบจุลินทรีย์
การเจาะลำไส้
ความเสี่ยงของลำไส้ใหญ่ในการเจาะรู (perforation) เป็นเรื่องยาก แต่เป็นภาวะแทรกซ้อนร้ายแรงที่อาจเกิดขึ้นกับ IBD การเจาะเป็นเรื่องปกติมากที่สุดในช่วงเกิดแผลพุพองของลำไส้ใหญ่อักเสบที่แผลพุพองครั้งแรกและในผู้ที่มีผนังลำไส้มีอาการผอมเนื่องจากโรคร้ายแรง การเจาะรูได้รับการปฏิบัติมากที่สุดโดยการผ่าตัดเพื่อซ่อมแซมหลุมหรือแม้แต่ถอดส่วนของลำไส้ออก
มะเร็งลำไส้ใหญ่และทวารหนัก
คนที่มี IBD เสี่ยงต่อการเป็นมะเร็งลำไส้ใหญ่โดยเฉพาะคนที่มีอาการลำไส้ใหญ่บวมเป็นแผลเป็นเวลา 8 ถึง 10 ปี ผู้ที่เป็นโรค Crohn ก็มีความเสี่ยงแม้ว่าจะมีข้อมูลน้อยกว่าเกี่ยวกับระดับความเสี่ยง การตรวจอย่างรอบคอบเพื่อตรวจหามะเร็งลำไส้ใหญ่โดยการทำ colonoscopy เป็นสิ่งจำเป็นสำหรับทุกคนที่มี IBD แต่โดยเฉพาะอย่างยิ่งสำหรับผู้ที่มีความเสี่ยงสูง
รอยแยก
รอยแยกเป็นรอยร้าวเจ็บปวดในคลองทวารที่อาจทำให้เกิดเลือดออก รอยร้าวส่วนใหญ่จะหายได้โดยไม่ต้องผ่าตัด แต่ต้องใช้การรักษาเช่นครีมทาและให้แน่ใจว่า การเคลื่อนไหวของลำไส้ จะถูกส่งผ่านไปโดยไม่ทำให้เครียด รอยแยกที่ไม่สามารถรักษาและเป็นเรื้อรังอาจต้องผ่าตัด
ช่องในกะโหลก
ช่องทวารคือการเชื่อมต่อที่เหมือนอุโมงค์ผิดปกติระหว่างโพรงร่างกายสองช่องหรือระหว่างโพรงในร่างกายกับผิวหนัง Fistulas มีแนวโน้มที่จะพบได้บ่อยในโรค Crohn มากกว่าในลำไส้ใหญ่อักเสบที่เป็นแผลเป็นและในความเป็นจริงประมาณ 25% ของผู้ที่เป็นโรค Crohn อาจพัฒนาช่องทวารในช่วงระยะเวลาของโรค ร่องบางส่วนอาจได้รับการรักษาด้วยยา แต่ที่รุนแรงมากขึ้นหรือมากขึ้นพวกเขามีโอกาสมากขึ้นพวกเขาจะต้องผ่าตัดโรค Premenstrual
ผู้หญิงบางคนที่มี IBD สังเกตเห็นว่าอาการของพวกเขาแย่ลงในช่วงเวลาที่มีประจำเดือนของพวกเขา อาการท้องร่วงและอาการปวดอาจเพิ่มขึ้นก่อนและในช่วงที่มีประจำเดือน สาเหตุของอาการเหล่านี้อาจเพิ่มฮอร์โมนในระหว่าง รอบประจำเดือน
พิษ Megacolon
พิษของสิ่งมีชีวิตมีค่าน้อยมาก แต่เป็นภาวะที่อันตรายต่อชีวิต หากไม่ได้รับการรักษา megacolon ที่เป็นพิษอาจทำให้เกิดการช็อกการเจาะทะลุหรือการติดเชื้อในช่องท้องหรือในเลือด ในบางกรณีสามารถรักษาได้ในทางการแพทย์ แต่กรณีที่รุนแรงอาจต้องได้รับการผ่าตัด